1、低溫儲存
菜籽油需要在低溫環境下存儲，溫度太高容易發生化學反應，使菜籽油成分發生變化，不僅營養成分損失嚴重而且還會發生酸敗反應。因此，菜籽油不用時，應遠離爐灶和太陽照射，放置在陰涼處。
2、避光保存
菜籽油長時間與太陽光接觸會加速氧化酸敗，在紫外光的作用下，容易產生臭氧化物，生成不良氣味和滋味。影響菜籽油質量。因此，菜籽油不宜裝在白色透明的玻璃瓶內。塑料油桶有一定的透明度，因此，桶裝油也應避光。此外，長期使用某一裝油容器應定期清洗，濾干水分再用，因為水的混入也會加速水解和氧化酸敗。
3、密封保存
菜籽油是一種很容易發生氧化反應的食用油之一，如果把菜籽油敞開與空氣大面積接觸很容易發生氧化酸敗。因此，每次用過菜籽油后，要及時蓋緊油桶蓋，盡量降低含氧量。
4、添加保護劑
在菜籽油儲存罐中放入適量的食用鹽，用少量菜籽油使鹽充分的溶解，等到沒有食鹽沉淀后放置在陰涼處一段時間，澄澈后再把菜籽油倒入玻璃瓶中保存即可，可延長菜籽油保質時期。